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Les scores de qualité phred ont été originellement développés pour le programme Phred afin d'aider à l'automatisation du séquençage d'ADN lors du Projet Génome Humain. Ces scores de qualité sont assignés à chaque base nucléique issu d'un électrophorègramme de séquençage automatique. Ils sont devenus par la suite un standard permettant de caractériser la qualité d'une séquence d'ADN et sont utilisés pour comparer l'efficacité des différentes techniques de séquençage. Cependant, l'utilisation la plus courante de ces scores de qualité concerne la détermination de l'exactitude des séquences consensus basées sur la qualité de séquençage.

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