Variant de séquence d'amplicon
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Variant de séquence d'amplicon est un terme utilisé pour désigner des séquences d'ADN individuelles récupérées à partir d'une analyse de gène marqueur à haut débit à la suite de l'élimination de séquences parasites générées pendant l'amplification par PCR et le séquençage qui s'ensuit. Les ASV sont donc des séquences déduites d'origine biologique véritable. Le terme a été introduit pour faire la distinction entre, d'une part, les méthodes traditionnelles qui délimitent les unités taxonomiques opérationnelles générées en regroupant (clustering) des séquences basées sur un seuil de similarité partagé, et d'autre part, les nouvelles méthodes alternatives qui traitent des séquences individuelles sans besoin de clustering. Les méthodes ASV sont capables de traiter des séquences qui diffèrent même d'un nucléotide et évitent le regroupement basé sur la similitude ; pour ces raisons, les ASV sont également appelés variants de séquence exacte ou OTU à rayon nul.
